Microsoft анонсировала GVFS.
Можно просто почитать статью по ссылке, далее просто короткое описание.
TL;DR В Microsoft обнаружили, что на больших репозиториях (пара сотен гигабайт) Git подтормаживает :) И написали виртуальную файловую систему, которая забирает файл только тогда, когда он действительно нужен.
Disclaimer: Холивар по поводу того, Git тормозит или NTFS оставим любителям холиваров.
В статье приводятся замеры для описанного кейса (было/стало):
Если у вас похожий кейс с огромным репозиторием, рекомендую попробовать. Правда, сначала рекомендую задуматься — правильно ли у вас организован репозиторий.